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GARBELINI, JADER M. CALDONAZZO;
SANCHES, DANILO S.;
Aurora Trinidad Ramirez Pozo
Palavra-chave:
Aprendizado de Maquina;
clustering;
Bioinformática
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Metodologia e Técnicas da Computação; Inteligencia Artificial
resumo ...
Discovery biological motifs plays a fundamental role in understanding regulatory mechanisms. Computationally, they can be efficiently represented as kmers, making the counting of these elements a critical aspect for ensuring not only the accuracy but also the efficiency of the analytical process. This is particularly useful in scenarios involving large data volumes, such as those generated by the ChIP-seq protocol. Against this backdrop, we introduce biomapp::chip, a tool specifically designed to optimize the discovery of biological motifs in large data volumes. We conducted a comprehensive set of comparative tests with state-of-the-art algorithms. Our analyses revealed that biomapp::chip outperforms existing approaches in various metrics, excelling both in terms of performance and accuracy. The tests demonstrated a higher detection rate of significant motifs and also greater agility in the execution of the algorithm. Furthermore, the smt component played a vital role in the system’s efficiency, proving to be both agile and accurate in kmer counting, which in turn improved the overall efficacy of our tool. biomapp::chip represent real advancements in the discovery of biological motifs, particularly in large data volume scenarios, offering a relevant alternative for the analysis of ChIP-seq data and have the potential to boost future research in the field. This software can be found at the following address: (https://github.com/jadermcg/biomapp-chip).
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SILVA, ROBERT;
Mauricio Almeida Noernberg;
LOPES, ALEXANDRE
Palavra-chave:
nível do mar;
Áreas vulneráveis;
mudanças climáticas;
Inundação costeira
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Oceanografia; Oceanografia Física; Movimento da Água do Mar;
Ciências Exatas e da Terra; Oceanografia; Oceanografia Física; Interação do Oceano Com o Continente
resumo ...
Abstract Understanding the dynamics of sea surface variation and its direct effects on the...
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OLIVEIRA, CRISTHIAN SANTOS;
BARBOSA, FELIPE LUKACIEVICZ;
EHRENFRIED, CARLOS AUGUSTO;
RODRIGUES, TAYNÁ ELOYANE BARRETO;
Marcos José Salvador;
Aleksander Roberto Zampronio;
Stefanello, Maria Élida Alves
Palavra-chave:
Salvia melissiflora;
Lamiaceae;
diterpenos;
atividade antioxidante
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Química; Química Orgânica; Química dos Produtos Naturais
resumo ...
Chromatographic fractionation of dichloromethane and ethanol extracts of Salvia melissiflora Benth., Lamiaceae, aerial parts led to the identification of five known compounds through analyses of NMR data (1D and 2D) and comparison with literature data: oleanolic acid, ursolic acid, ent-(5R,9R)-15,16-epoxy-10S-hydroxyclerodan-3,13(16),14-triene-17,12S;18,19-diolide (melissiflorine), 7-epi-salvianduline A, and rosmarinic acid. The anti-inflammatory and antinociceptive activity of dichloromethane and ethanol extracts was evaluated in mice. The oral administration of ethanol extract reduced the second phase of formalin-induced nociception, lipopolysaccharide (LPS)-induced hyperalgesia, and carrageenan-induced edema in mice. The oral administration of dichloromethane extract also reduced LPS-induced hyperalgesia without altering motor performance of the animals. The anti-inflammatory and antinociceptive effects are probably related to the presence of rosmarinic acid, oleanolic acid, and ursolic acid, respectively. The antioxidant activity of the extracts was evaluated using the ORAC method. The ethanol extract showed activity (TE relative, 2845.2 µmol TE g−1), which can be attributed to the major presence, in this extract, of rosmarinic acid, which showed an antioxidant capacity comparable to that of caffeic acid.
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RIBEIRO, KEVYN SWHANTS DOS SANTOS;
VIEIRA, MARCELO BERNARDES;
VILLELA, SAULO MORAES;
RENHE, MARCELO CANIATO;
Hélio Pedrini;
NAVARRO, JOÃO PAULO
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Ciência da Computação; Metodologia e Técnicas da Computação; Engenharia de Software
resumo ...
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GREBOGY, ELAINE CRISTINA;
Marcos Alexandre Castilho;
SANTOS, ICLÉIA
Palavra-chave:
Educação em Computação;
Pensamento computacional
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Ciência da Computação; Metodologia e Técnicas da Computação; Engenharia de Software
resumo ...
(en)
This study brings the results of a research carried out with elementary school students that aimed to evaluate the impact that unplugged computing activities have on the construction of computational thinking. The students were evaluated with pre and post-tests and the results point to a 45% increase in skills related to computational thinking after interventions carried out exclusively with unplugged activities. Additionally, it presents material created exclusively for elementary school I with a playful and concrete proposal to work on computational concepts and computational thinking without the need for electronic equipment. The pertinence of the activities for the age group, allowed the exploration of concrete materials associated with motor games, which contributed to the engagement of the participants in the proposal and pointed to the need to invest in similar actions, which promote skills related to the computational thinking as early as possible. In addition to the positive results obtained from the experiment, the need to establish continuity in practices is evident with the most recent insertion of computing in addition to the National Common Curricular Base and with the enactment of the National Policy on Digital Education.
(es)
Este estudio trae los resultados de una investigación realizada con estudiantes de la escuela primaria que tuvo como objetivo evaluar el impacto que las actividades de computación desconectada tienen en la construcción del pensamiento computacional. Los alumnos fueron evaluados con pre y post test y los resultados apuntan a un aumento del 45% en las habilidades relacionadas con el pensamiento computacional tras intervenciones realizadas exclusivamente con actividades desconectadas. Además, presenta material creado exclusivamente para primaria I con una propuesta lúdica y concreta para trabajar conceptos computacionales y pensamiento computacional sin necesidad de equipos electrónicos. La pertinencia de las actividades para el grupo de edad, permitió la exploración de materiales concretos asociados a los juegos motores, lo que contribuyó para el compromiso de los participantes en la propuesta y señaló la necesidad de invertir en acciones similares, que promuevan habilidades relacionadas con el computacional pensando lo antes posible. Además de los resultados positivos obtenidos de la experiencia, se evidencia la necesidad de establecer una continuidad en las prácticas con la más reciente incorporación de la informática a la Base Curricular Común Nacional y con la promulgación de la Política Nacional de Educación Digital.
(pt)
Este estudo apresenta os resultados de uma pesquisa realizada com estudantes do ensino fundamental I cujo objetivo foi avaliar o impacto que as atividades de computação desplugada exercem na construção do pensamento computacional. Os estudantes foram avaliados com pré e pós-testes e os resultados apontam um incremento de 45% das habilidades relacionadas ao pensamento computacional após as intervenções realizadas exclusivamente com atividades desplugadas. Adicionalmente, este trabalho apresenta um material criado especialmente para os anos iniciais do ensino fundamental com uma proposta lúdica e concreta para se trabalhar conceitos computacionais e de pensamento computacional sem a necessidade de equipamentos eletrônicos. A pertinência das atividades para a faixa etária permitiu a exploração de materiais concretos associados à realização de jogos motores, o que contribuiu para o engajamento dos participantes na proposta e apontou para a necessidade de se investir em ações similares que promovam as habilidades relacionadas ao pensamento computacional o mais precocemente possível. Além dos resultados positivos colhidos com o experimento, a necessidade de se estabelecer uma continuidade nas práticas se evidencia com a mais recente inserção da computação em complemento à Base Nacional Comum Curricular e com a promulgação da Política Nacional de Educação Digital.
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LOPES, ALEXANDRE;
DOS SANTOS, FERNANDO PEREIRA;
DE OLIVEIRA, DIULHIO;
SCHIEZARO, MAURICIO;
Hélio Pedrini
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Ciência da Computação; Metodologia e Técnicas da Computação; Engenharia de Software
resumo ...
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Carlos Eduardo de Mesquita Barros;
Gláucia Nascimento Queiroga
Palavra-chave:
CARAJAS;
veining;
veins of amphibole;
Archean;
amphibolites
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Geociências; Geologia; Petrologia;
Ciências Exatas e da Terra; Geociências; Geologia; Mineralogia;
Ciências Exatas e da Terra; Geociências; Geologia; Prospecção Mineral
resumo ...
Abstract In the Carajás Province, many Au and Cu deposits are hosted in Archean metabasic rocks...
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LEÃO, JOYCE DE M.;
YOKAICHIYA, FABIANO;
MATTOSO, NEY;
VIANA, EMILSON R.;
SAUL, CYRO K.;
Evaldo Ribeiro
Palavra-chave:
nanofios;
óxido de cério
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Física da Matéria Condensada; Prop. Óticas e Espectrosc. da Mat. Condens; Outras Inter. da Mat. com Rad. e Part.
resumo ...
Dispersions of polymer and cerium acetate were deposited by electrospinning as nanofibers onto a metallic target, with the concentration of the precursor varied from 15% down to 3% (in weight). The different samples of deposited material were then transformed into CeO2 nanowires by thermal treatment at temperatures ranging from 350 to 950 °C. Raman Spectroscopy and X-Ray Diffraction data indicate a full conversion into cerium dioxide for all mass ratios without indicating other stoichiometries. Scanning Electron Microscopy shows the formation of nanowires, with diameters varying from (81 ± 5) nm to (200 ± 10) nm for cerium acetate concentrations ranging from 3%, 5%, 10%, and 15%. Transmission Electron Microscopy reveals that the nanowires are polycrystalline, and nanocrystal average sizes are compatible with the crystalline coherence length extracted from X-Ray Diffraction. The Thermal Treatment temperature does not seem to affect the nanowire average diameter; thus, this fabrication method's main control parameter for tailoring the CeO2 nanowire diameter by this fabrication method is the cerium acetate concentration within the deposition solution.
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José Severiano Carneiro Neto;
EDUARDO MARIANO IWAYA;
SANTANA, FRANCIELLI SOUSA;
Jaisa Fernandes Soares
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION E, CRYSTALLOGRAPHIC COMMUNICATIONS,
v. 80,
n. 6,
p. 1-10,
2024
DOI
Home page
Palavra-chave:
4,4-dimethyl-2-phenyl-2-oxazoline;
trigonal planar;
lithium(I);
hexamethyldisilylamide;
crystal structure
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Química; Química Inorgânica; Química de Coordenação;
Ciências Exatas e da Terra; Química; Química Inorgânica; Determinação de Estrutura de Compostos Inorgânicos
resumo ...
The reaction of lithium hexamethyldisilylamide, [Li{N(Si(CH3)3)2}] (LiHMDS), with 4,4-dimethyl-2-phenyl-2-oxazoline (Phox, C11H13NO) in hexane produced colourless crystals of bis(4,4-dimethyl-2-phenyl-2-oxazoline-κN)(hexamethyldisilylamido-κN)lithium, [Li(C6H18NSi2)(C11H13NO)2] or [Li{N(Si(CH3)3)2}(Phox)2] in high yield (89%). Despite the 1:1 proportion of the starting materials in the reaction mixture, the product formed with a 1:2 amide:oxazoline ratio. In the unit cell of the C2/c space group, the neutral molecules lie on twofold rotation axes coinciding with the Li—N(amide) bonds. The lithium(I) centre adopts a trigonal–planar coordination geometry with three nitrogen donor atoms, one from the HMDS anion and two from the oxazolines. All ligands are monodentate. In the phenyloxazoline units, the dihedral angle defined by the five-membered heterocyclic rings is 35.81 (5)°, while the phenyl substituents are approximately face-to-face, separated by 3.908 (5) Å. In the amide, the methyl groups assume a nearly eclipsed arrangement to minimize steric repulsion with the analogous substituents on the oxazoline rings. The non-covalent interactions in the solid-state structure of [Li{N(Si(CH3)3)2}(Phox)2] were assessed by Hirshfeld surface analysis and fingerprint plots. This new compound is attractive for catalysis due to its unique structural features.
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SANTOS BEZERRA, THAIS MARIA;
MEIDANIS, JOAO;
SILVA DE DEUS, MATHEUS;
CAVALARO, FELIPE;
RIBEIRO, DENISE;
SEIDINGER, ANA LUIZA;
CARDINALLI, IZILDA APARECIDA;
DE MELO PORCARI, ANDREIA;
DE SOUZA QUEIROZ, LUCIANO;
Hélio Pedrini
Áreas do conhecimento:
Ciências Exatas e da Terra; Ciência da Computação; Metodologia e Técnicas da Computação; Engenharia de Software
resumo ...
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